La ciudad de Machu Picchu está conectada a la ciudad de Cusco (el mundo es el ombligo) por un sistema ferroviario que une ambos centros turísticos. El viaje dura aproximadamente tres horas, a través de paisajes paradisíacos, cubriendo una distancia de 110 kilómetros, con frecuencias diarias y numerosas opciones con respecto a horarios, categorías y tarifas. El Santuario Histórico de Machu Picchu está estratégicamente ubicado en la cima de la montaña Machu Picchu, en 2.350 metros sobre el nivel del mar (7.710 pies) en la Cordillera de Vilcabamba es la vertiente occidental.
La Cordillera de Vilcabamba está bordeada por los ríos Apurímac y Urubamba. El Santuario Histórico está ubicado específicamente en el Valle del Río Urubamba (también conocido como Vilcanota) en la parte inferior del Valle Sagrado de los Incas, desde donde se puede acceder al bosque alto.